Pełne szyfrowanie w WhatsApp dostępne jest, kiedy zarówno Ty, jak i osoby z którymi się komunikujesz, korzystacie z najnowszej wersji aplikacji. Wiele komunikatorów szyfruje wiadomości jedynie pomiędzy Tobą i samymi sobą. W WhatsApp natomiast, pełne szyfrowanie zapewnia, że tylko Ty i osoba, z którą się komunikujesz, możecie odczytać wysłane treści, i nikt poza Wami, nawet WhatsApp. Twoje wiadomości zabezpieczone są jakby unikatowym zamkiem, do którego jedynie odbiorca i Ty macie specjalny klucz umożliwiający otworzenie i przeczytanie wiadomości. Dla dodatkowego zabezpieczenia, zamek i klucz jest inny dla każdej wysyłanej wiadomości. Wszystko to dzieje się automatycznie: nie ma konieczności włączania żadnych ustawień ani zakładania specjalnych sekretnych czatów, aby bezpiecznie się komunikować.