يتوفر التشفير التام بين الطرفين في واتساب عندما تستخدم أنت والطرف الذي تراسله تطبيق واتساب. وفي حين أن العديد من تطبيقات المراسلة تعمل على تشفير الرسائل بينها وبين مستخدميها فقط، فإن التشفير التام بين الطريفن في واتساب يحمي معلوماتك فلا يمكن لأحد، بما في ذلك واتساب، قراءة محتوى دردشاتك باستثنائك أنت والطرف الآخر الذي تتواصل معه. ويعود ذلك إلى أن رسائلك محمية بواسطة قفل التشفير، ووحدك أنت والطرف الذي تدردش معه تملكان المفتاح الخاص لفتح قفل هذه الرسائل وقراءتها. وللمزيد من الحماية، فإن كل رسالة ترسلها لها قفل فريد ومفتاح فريد. وجدير بالذكر أن التشفير التام يجري تلقائيًا: فليس هناك أي إعدادات يجب تشغيلها أو أي عمليات ضبط لدردشات سرية خاصة يجب إجراؤها لحماية رسائلك.

إن عمليات الدفع عبر واتساب، المتوفرة في بلدان محددة، تتيح إجراء التحويلات بين الحسابات عبر المؤسسات المالية. ويتم تخزين أرقام البطاقات وحسابات البنوك بشكل مشفّر وعبر شبكة مؤمّنة بدرجة عالية. غير أنه ينبغي العلم بأن المؤسسات المالية لا يمكنها معالجة هذه المعاملات بدون تلقّي المعلومات المرتبطة بعمليات الدفع، ولذلك لا تخضع عمليات الدفع للتشفير التام بين الطرفين.